一階建ての簡単な駅舎がある。前の駅舎が原爆で焼失した後、建てられたものである。コンビニエンスストアam/pmが駅舎内部に設けられている。
自動券売機が1台設置されている。自動改札は無いがマルス (システム) マルス端末機が設備されている。JR九州鉄道駅#直営駅 直営駅である。
プラットホーム#分類 相対式ホーム2面2線の構造を持つ。駅舎側が長崎方面下りホーム、奥が諫早方面上りホームである。ホームとホームとの間の移動には、跨線橋を利用する。
浦上駅から諫早方面に2～300mほど進むと、踏切の手前にクロスポイントがある。
ここが、新線と旧線の分岐ポイントである。そのまま直進し旧線に向かう列車は、旧線が電化されていないためすべて気動車である。一方、ポイントを曲がる列車は、電化された新ルートを通る列車である。
浦上駅 浦上駅前駅 浦上教会 浦上天主堂 浦上壮史 浦上村宗 浦上四番崩れ 浦上車庫前駅 浦上氏 浦上春琴 浦上宗景 浦上靖夫 浦上玉堂 浦上則宗 浦上宗久 浦上直宗 浦上久松丸 浦上政宗 浦上誠宗 浦上国秀
